Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών «Ειδική Αγωγή» διοικείται από τη Γενική Συνέλευση Ειδικής Σύνθεσης (ΓΣΕΣ) του Τ.Ε.Α.Π.Η. Τα θέματα που αφορούν το ΠΜΣ εισηγούνται τα μέλη Συντονιστικής Επιτροπής, που για το ακαδημαϊκό έτος 2015-2016 ορίστηκαν ως εξής:
Διευθυντής ο αναπληρωτής καθηγητής Βασίλης Τσάφος
Μέλη η Επίκουρη καθηγήτρια Ευδοξία Ντεροπούλου-Ντέρου και η Επίκουρη καθηγήτρια Καλλιρρόη Παπαδοπούλου.
Αναπληρωματικό μέλος Αγγελική Γιαννικοπούλου